孝明天皇犹豫不决。

一桥庆喜道：启禀陛下，兵行险地，非召即入，此例若开，普天之下，二百余藩，人人可以执戈入洛。

孝明天皇思忖再三，道：去岁，尔等偕会津中将松平容保驱逐长州藩众出京，乃朕之意。今日，长州藩非诏妄行，兵抵京畿，确属忤逆。尚望长藩悬崖勒马，自行退却。为防万一，速传朕旨，著禁里守卫总督一桥庆喜总统各藩入洛之军，卫戍御所；会津、萨摩、桑名等藩，务必遵照执行。

孝明谕旨传至伏见，长州藩人众说纷纭，聚讼不休。

长州藩士久坂玄瑞振臂疾呼：非召入京，吾等皆为乱臣贼子，天下共击之。且依陛下天音，暂退至兵库待命。

长州藩家督来岛又兵卫斥曰：退至兵库，又能如何？兵进御门，俯首请愿，乃藩主既定之策，尔已言听计从，今何故复又朝三暮四？尔非如此，请自偕奇兵队作壁上观，吾率游击大军，御门请愿。

长州藩家老国司信浓附议。

长州藩主帅福原越后道：吾等所率，皆乃清侧义军也。即以吾等之力，肃清君侧佞臣奸贼，恳请吾皇恢复家主官位，赦免三条实美等落难七卿之罪；雄心于我，无往而不能矣！速传吾令，兵分三路，直进御门，违令者，杀无赦。

8月20日晨，来岛又兵卫督率游记队杀至蛤御门。

中午时分，久坂玄瑞亦率奇兵队进抵堺町门。

禁里守卫总督一桥庆喜、京都守护职松平容保紧急参觐，松平容保上言：启禀陛下，臣即率新撰组、大垣藩兵直出御门，迎击叛军主力福原越后部；臣抱病出征，必定铲除逆贼，平息战乱，誓死护卫陛下周全。。

一桥庆喜亦曰：启禀陛下，长州匪军围攻御所，臣已饬令会津、萨摩、桑名各藩分守蛤御、乾门、堺町等九门；然无陛下敕许，各藩抑或敷衍塞责，恳请陛下下敕讨伐。

孝明天皇亦急，不假思索，直道：京都安危，仰仗二卿也！速传朕旨，长州匪兵非召入洛，诸藩务必群起而攻之。

萨摩藩家老小松带刀接敕，谓军赋役西乡隆盛道：陛下敕令既下，吾藩务必遵照执行。此处不见长州一兵，蛤御门、堺町门接连告急，救援否？

西乡隆盛道：禁里守卫总督饬令吾等拱卫乾门，此门若失，你我难辞其咎。功高莫过于救驾，作壁上观，且待最佳之机。