河中节度使王重荣因与宦官田令孜有过节,田令孜进言派王重荣调任兖州,任命定州的王处存为河中节度使,并下诏书让李克用出兵保护王处存的辖地。王重荣命人转告李克用:“天子下诏书给他,等李克用来了,让他与王处存一起诛杀李克用。”并因此伪造诏书给李克用看,说:“这是朱温的阴谋。”李克用信以为真,八次上表请求讨伐朱温,唐僖宗不同意,李克用非常愤怒。
王重荣不受命调任,唐僖宗命邠州的朱玫、凤翔的李昌符去讨伐他,而李克用却出兵相助王重荣,在沙苑击败朱玫,引兵攻打长安,到处纵火、掠夺。唐僖宗出逃到兴元,李克用退兵驻扎河中,朱玫造反出兵追唐僖宗,但没有赶上唐僖宗,只是抓住了襄王李煴。朱玫逼迫李煴称帝,屯兵凤翔,唐僖宗认为只有李克用能击败朱玫,但李克用却不愿为唐僖宗所用。
当初在长安破黄巢时,天下兵马都监杨复恭与李克用关系很好,唐僖宗派谏议大夫刘崇望带着诏书去征召李克用,并说是杨复恭的想法,让李克用出兵讨伐朱玫等势力,李克用表面上答应了,但却不带兵前往。
李克用击破孟迁,夺取邢、洺、磁三州,又命安金俊在云州攻打赫连铎。幽州李匡威出兵救赫连铎,李匡威与安金俊在蔚州交战,安金俊大败。于是,李匡威、赫连铎和朱温都上书趁李克用战败要乘机讨伐他,唐昭宗认为李克用破黄巢功高,不该去讨伐他,召集台省四品以上官员讨论这事,参加讨论的官员大多说不可以讨伐李克用。宰相张浚一人认为沙陀部族曾逼僖宗逃难至兴元,罪该至死,可以讨伐,军容使杨复恭与李克用交情很好,他也极力上谏认为不可以讨伐,唐昭宗同意了他的谏言,下诏书告知朱温等人。
朱温暗中贿赂张浚,让张浚更加坚定原来的建议,唐昭宗迫不得已,任命张浚为太原四面行营兵马都统,韩建为副使,前去讨伐李克用。潞州将领冯霸叛变向朱温投降,朱派葛从周入驻潞州,唐朝廷任命京兆尹孙揆为昭义军节度使,李克用派李存孝在长子抓了孙揆,又派康君立夺取了潞州。张浚与李克用在阴地交战,张浚军三战三败,张浚、韩建逃回。李克用的军队在晋、绛大肆掠夺,直到河中,所到之处满目疮痍、一片凄凉。李克用上表诉述事情,言辞傲慢,唐昭宗为此向他认错,下诏书好言好语回复他。
唐昭宗再次任命李克用为河东节度使,加封陇西郡王,同时任命李克用为检校太师兼中书令。李克用攻打的云州赫连铎,围困赫连铎一百多天,赫连铎逃往吐浑。李克用军队在太原大肆掠夺,并离开晋、绛,夺取怀、孟二地,又来到邢州作为根据地,攻打镇州的王镕。李存孝夺取临城,进攻元氏,卢龙节度使李匡威出兵救王镕,李克用退兵邢州。
王镕攻打败退邢州的李克用,部将李存信、李嗣勋等在尧山击败王镕。李克用又与王处存攻打王镕,两军在新市交战,李克用、王处存联军被王镕击败。李匡威攻打云州,以牵制李克用的兵力,李克用暗中返回云州,出兵击败李匡威。
李存孝在邢州叛变李克用,李存孝向敌军王镕求救,李克用出兵井陉攻打王镕,又发书信招降王镕,同时猛攻王镕的平山。王镕惧怕破城,于是和李克用通行求和,向李克用献帛五十万匹,并出兵帮助攻打邢州李存孝。李克用擒住盘踞邢州的李存孝,并将其处死,李克用攻打幽州,李匡俦弃城出逃,李克用追至景城,杀了李匡俦,任命刘仁恭作为留后。
河中节度使王重盈去世,他的儿子王珂、王珙争位,李克用上书请求王珂继位,凤翔李茂贞、邠宁王行瑜、华州韩建上书请求王珙继位。唐昭宗开始左右为难,任命宰相崔胤为河中节度使,后来又同意李克用立王珂。李茂贞等人非常生气,三处共同起兵前往攻打长安,后听说李克用也出兵前来,才都收兵回去。
李克用攻克绛州,斩杀刺史王瑶,李克用来到河中,同州王行约前去长安,散布谣言说:“李克用的沙陀军队十万人马杀来了!”王行约想让唐昭宗移驾邠州,李茂贞的干儿子阎圭,想把唐昭宗劫到凤翔,一时间长安大乱,唐昭宗出逃来到石门。李克用军队在河中一个多月,都没往长安方向进发,唐昭宗派延王戒丕、王允兄两人在李克用处做事,并告知长安的危急情况。